Şamaxı rayonu flora və bitki örtüyü baxımından Azərbaycanın ən zəngin rayonlarından biridir. Azərbaycanda dağ çöl formasiyasının ən geniş areallarından biri də məhz bu rayonun payına düşür. Quru çöl və çöl bitkiləri arid-seyrək meşələrlə və müxtəlif kollarla qarışıq formasiyalar yaradır. Rayon ərazisində yayılan quru çöl və çöl bitkiliyi başdan-başa əkinçilik və ya qış otlaqları kimi istifadə olunur. Bu sahələrdə yovşan, yovşan-efemer yarımsəhralarına rast gəlinir. Yovşan, soğanaqlı qırtıc (Poa bulbosa), yapon tonqalotu (Bromus japonicus), bərk quramat (Dolium rigidum), çilikburnu (Erodium cicaturium), bəzi sahələrdə yovşan və efemerlərlə yanaşı lalələr, mollabaşı bitkilikdə xüsusi bir mənzərə yaradır.
Yarımsəhra bitkilik tipi rayon ərazisində qismən geniş yayılmışdır. Bu bitkilik tipinin heyvandarlığın, əsasən də xırdabuynuzlu mal-qaranın inkişafında qış otlaqları kimi xüsusi mühüm əhəmiyyəti vardır. Burada yarımsəhranın ağotlu-yovşanlı, topallı-yovşanlı, yovşanlı-ayrıqlı və d. formaları təşəkkül tapmışdır. Yarımsəhra bitkilliyi yerində bərpa olunmuş mədəni bitkilik, əsasən taxıl və üzümlük sahələri-bəzən də meyvə bağlaı və bostan bitkiliyi ilə əvəz olunmuşdur.

Azərbaycanın qiymətli texniki üzüm sortudur. Əsasən Şamaxıda, qismən də Abşeron, Samux, Ağsu, İsmayıllı və Gəncədə becərilir. Şamaxının indiki Mədrəsə qəsəbəsində yetişdirilmişdir. Tənəyi güclü boy atır.

Azərbaycanın qiymətli süfrə üzüm sortudur. Əsasən Şamaxıda, qismən də Abşeron, Ağsu, İsmayıllı və Gəncədə becərilir. Tənəyi güclü boy atır. Giləsi tünd-qırmızı yaxud tünd-yaşıldır. Tam yetişdikdə açıq-qara olur. Vegetasiya dövrü 154-180 gündür. Şirəsində 19,2 % şəkər, 5,3 qr/l turşu olur. Əkildikdən 4 il sonra məhsul verir. Tünd-şabalıdı torpaqlarda yaxşı inkişaf edir. Azərbaycanın üzüm sortları standartına daxildir.

Əd.: “Şamaxı tarix-diyarşünaslıq muzeyi”, Bakı, 2009, s. 21

Qərənfilkimilər fəsiləsindən çoxillik, tünd-göy rəngli ot bitkisi. Çiçəklənmə – meyvə əmələgətirmə dövrü iyun ayına təsadüf edir. Quraqlığa davamlı, işıqsevəndir. Böyük Qafqazın şərqi (Bakı-Şamaxı yolu, Şamaxı rayonu – Daşlıca dağı), Abşeron (Güzdək yaylası), Kür-Araz ovalığı (Qaradağ rayonu – Qobustan qəsəbəsi), Samur-Dəvəçi ovalığında ( Şabran rayonu, Gilgilçay boyu, Beşbarmaq dağı) yayılmışdır.

Əd.: Azərbaycan Respublikasının Qırmızı kitabı, Bakı, “Şərq-Qərb”, 2013, s. 268-269

Qurğuşun çiçəyi fəsiləsindən Azərbaycanın məhdud endemik bitki növüdür. Dəvəçi rayonunda Ərəblər, Güləh, Daşlı Calqan kəndləri ətrafında, Ağburun dağında, Şamaxı rayonunda yayılmışdır. Aşağı dağ qurşağının quru, daşlı yamaclarında bitir.

Əd.: Azərbaycan SSR-in Qırmızı kitabı, Bakı, “İşıq”, 1989, s.469-470